曹操见无懈可击，又师老兵疲，经下邳焚城士气也不高，逐退军北返。回到淮南后，纳程昱言，改淮南为寿春，令张辽、乐进、李典三将领兵2万驻守。
曹操一退，荀攸、张颌也退了，张颌屯小沛，其他诸将分驻各城，荀攸回许昌复命。
诸葛亮见曹操退兵，逐安排议事，令三路攻交州，尽快一举拿下交州，然后在交州建海船，找橡木，育种水稻。
东路军以吕岱为将，蒋琬为军师，从吴县至钱塘至晋安直至番禺；西路以全琮为将，杜畿为军师从零陵出兵，顺漓水而下，直击苍梧郡的广信（也就是现在的梧州），西路要抢占离水关。
中路由徐盛为将，步骘为军师领一路军自彬县至桂阳，再顺湟水而下抢占阳山关，与另一路偏师诸葛行自横浦关而出，共同攻占湟溪关，然后直击南海郡首府番禺。
又令杨仪为桂阳郡太守，令孟建为零陵郡太守；在张羡叛乱时，刘表曾要求赖恭、吴巨从南往北攻，可赖恭与吴巨不和，他们与张羡也不清不楚，引刘表不满，早想伐交州了。
只是后来为了让诸葛亮出兵相助，才让出桂阳、零陵两郡，现在诸葛亮南攻交州，刘表没什么表示。
时交州分成三块，吴巨占据南海郡、苍梧郡东南部分、高凉郡的东部，治所番禺。
赖恭占据苍梧郡大部、合浦郡大部、朱漄郡、郁林郡大半、小半高凉郡，治所广信。
而曹操以朝廷名义封“绥南中郎将，督交州七郡”的交趾太守士燮，则占据交趾郡、九真郡、日南郡、郁林郡的西南部及合浦郡西南小部分。
三人实力相当，可当诸葛亮三路攻交州，以西路最快，全琮顺水而下，伪成商队抢占离水关时，关口上的人一个都没逃走，全部俘获。
全琮、杜畿立即围攻广信城，打了赖恭一个措手不及，一鼓而下广信，赖恭逃跑被全琮追上一刀劈了。
中路步骘、徐盛攻下阳山关，直抵湟溪关，攻打湟溪关三天后，湟溪关被绕到后面的诸葛行四千人偷袭攻破。
原来，诸葛行接到命令时，同时到达的还有二千连弩营，他立即隐蔽出关想偷袭湟溪关。
湟溪关险峻，当为交州第一大关，是湖南下广东的唯一要道，吴巨在此屯有重兵，当山阳关失守的消息传来，番禺还派出了一万援军。
诸葛行的斥候打探出湟溪关有重兵，可不他四千人能下的，就隐蔽在关口附近，向当地的猎人打探另外的小路绕行。
当徐盛军到湟溪关时，正面吸引了关口守军的注意力。因徐盛军攻得非常猛，关口守将就将后边一个小山口关上的五百守兵调到关口上，给了诸葛行一个可乘之机。
当诸葛行在猎人的带领下来到小山口关时，背上惊出一身冷汗，要是这五百人还在，他们四千人估计得交待在这一半人以上，还未必能攻得下来。
随即诸葛行率部潜行到湟溪关后面，在连弩营持续火力的攻击下一举攻破湟溪关，迎接徐盛、步骘入关。
他们攻下湟溪关后二个时辰，吴巨的援兵就到了，援兵一见湟溪关已失立马退回番禺，徐盛他们尾追直趋番禺。
番禺是坚城，他们相持二十多天，依然不能攻破。吕岱、蒋琬经过艰难行军才到南海郡，一路大部分是羊肠小道，还崇山峻岭，又经常被河流挡住，到了揭阳才算走出来了。
吴巨吸引力及兵力全在与徐盛的大战上，致使吕岱他们一路无阻，以极快的速度从后面包抄到了番禺城的后面。
吴巨这才大惊失色，守军也是心里震动，士气低落，在前后夹攻下，番禺陷落，吴巨被俘。
步骘为了震慑南海郡，公开斩杀吴巨，并将尸体挂在城头上示众，交州震动。随后士燮在吕岱、全琮的双路攻击下，投降。
报捷到建业，诸葛亮任命：步陟为交州刺史，升吕岱为正义中郎将、交州都尉。
又将交州九郡合并为两郡，南海郡合并苍梧郡、高凉郡、合浦郡、朱漄郡，名仍为南海郡，治所番禺。由蒋琬为南海郡太守，徐盛为南海郡都尉、南海水军都督。
交趾君合并九真郡、日南郡、郁林郡，名为交趾郡，治所龙编，以杜畿为交趾郡太守，升全琮为奋威校尉、交趾都尉。
令士燮全家迁宛陵，半路反叛，被杀且夷三族，自此交州平定。
在出行前诸葛亮就与蒋琬深谈过几次，现在交州平定，黄承彦通过零陵灵渠顺漓水而下，带着大队造船匠师，来番禺建尖底五层楼船。
五层楼船在南昌已经建造了两艘，其中一艘还从划桨式改为螺旋桨式，由一轮杆直通，两边各七组踩桨，共七十人，速度比划桨快的多，且不受战斗影响。
可经常进水，没有严密橡胶密封，只能通过树胶分三个小仓逐步隔水，大受影响，且还需经常更换，树胶容易脱落及变软。
占领交州，第一任务就是建尖底楼船出海，找到橡胶树制造橡胶。所以这次，尖底五层楼船，改成双螺旋桨，船仓加大加宽。
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